YKL-5-124 是一种有效的、选择性不可逆CDK7共价抑制剂，对CDK7和CDK7/Mat1/CycH的IC50分别为 53.5 nM 和 9.7 nM。YKL-5-124 对CDK7的选择性比 CDK9 和 CDK2 高 100 倍以上，并且对 CDK12 和 CDK13 没有活性。YKL-5-124 诱导强烈的细胞周期停滞，并抑制 E2F 驱动的基因表达，并且对 RNA 聚合酶 II 磷酸化状态几乎没有影响。
| 生物活性 | YKL-5-124 is a potent, selective, irreversible and covalentCDK7inhibitor withIC50s of 53.5 nM and 9.7 nM forCDK7andCDK7/Mat1/CycH, respectively. YKL-5-124 is >100-fold greater selective forCDK7thanCDK9andCDK2, and inactive againstCDK12andCDK13. YKL-5-124 induces a strong cell-cycle arrest, inhibits E2F-driven gene expression, and exhibits little effect on RNA polymerase II phosphorylation status[1]. |
| IC50& Target[1] | CDK7 53.5 nM (IC50) | CDK7/Mat1/CycH 9.7 nM (IC50) | CDK2 1300 nM (IC50) | CDK9 3020 nM (IC50) |
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体外研究
(In Vitro) | YKL-5-124 (0-2000 nM; 72 hours; HAP1 cells) treatment causes a dose-dependent increase in G1- and G2/M-phase cells and a corresponding loss of S-phase cells[1].
YKL-5-124 (0-2000 nM; 24 hours; HAP1 WT cells) treatment inhibits CDK1 T-loop phosphorylation, and to a lesser extent CDK2 T-loop phosphorylation in a concentration-dependent fashion[1].
Treatment of cells with YKL-5-124 as a competitor at a concentration of about 30 nM blocks pull-down of CDK7-cyclin H but has no effect on the pull-down of cyclin K-CDK12/13 in HAP1 cells. Treatment with 100 nM YKL-5-124 reduces CDK7-cyclin H binding to bioTHZ1 by >50% at 30 min[1].
Cell Cycle Analysis[1] | Cell Line: | HAP1 cells | | Concentration: | 0 nM, 0.2 nM, 0.7 nM, 2 nM, 6.3 nM, 20 nM, 60 nM, 200 nM, 633.3 nM, 2000 nM | | Incubation Time: | 72 hours | | Result: | Caused a dose-dependent increase in G1- and G2/M-phase cells and a corresponding loss of S-phase cells. |
Western Blot Analysis[1] | Cell Line: | HAP1 cells | | Concentration: | 0 nM, 125 nM, 250 nM, 500 nM, 1000 nM, 2000 nM | | Incubation Time: | 24 hours | | Result: | Inhibited CDK1 T-loop phosphorylation, and to a lesser extent CDK2 T-loop phosphorylation in a concentration-dependent fashion. |
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| 分子量 | |
| 性状 | |
| Formula | |
| CAS 号 | |
| 运输条件 | Room temperature in continental US; may vary elsewhere. |
| 储存方式 | | Powder | -20°C | 3 years | | 4°C | 2 years | | In solvent | -80°C | 6 months | | -20°C | 1 month |
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| 溶解性数据 | In Vitro: DMSO : 100 mg/mL(193.95 mM;Need ultrasonic) 配制储备液 | 1 mM | 1.9395 mL | 9.6973 mL | 19.3945 mL | | 5 mM | 0.3879 mL | 1.9395 mL | 3.8789 mL | | 10 mM | 0.1939 mL | 0.9697 mL | 1.9395 mL |
*请根据产品在不同溶剂中的溶解度选择合适的溶剂配制储备液；一旦配成溶液，请分装保存，避免反复冻融造成的产品失效。
储备液的保存方式和期限：-80℃, 6 months; -20℃, 1 month。-80℃ 储存时，请在 6 个月内使用，-20℃ 储存时，请在 1 个月内使用。 In Vivo: 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解方案。以下溶解方案都请先按照In Vitro方式配制澄清的储备液，再依次添加助溶剂： ——为保证实验结果的可靠性，澄清的储备液可以根据储存条件，适当保存；体内实验的工作液，建议您现用现配，当天使用；
以下溶剂前显示的百
分比是指该溶剂在您配制终溶液中的体积占比；如在配制过程中出现沉淀、析出现象，可以通过加热和/或超声的方式助溶 1. 请依序添加每种溶剂： 10% DMSO 40%PEG300 5%Tween-80 45% saline Solubility: ≥ 2.08 mg/mL (4.03 mM); Clear solution
此方案可获得 ≥ 2.08 mg/mL (4.03 mM，饱和度未知) 的澄清溶液。 以 1 mL 工作液为例，取 100 μL 20.8 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀；然后继续加入 450 μL生理盐水定容至 1 mL。 2. 请依序添加每种溶剂： 10% DMSO 90% (20%SBE-β-CDin saline) Solubility: 2.08 mg/mL (4.03 mM); Suspended solution; Need ultrasonic
此方案可获得 2.08 mg/mL (4.03 mM) 的均匀悬浊液，悬浊液可用于口服和腹腔注射。 以 1 mL 工作液为例，取 100 μL 20.8 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 900 μL20% 的 SBE-β-CD 生理盐水水溶液中，混合均匀。 3. 请依序添加每种溶剂： 10% DMSO 90%corn oil Solubility: ≥ 2.08 mg/mL (4.03 mM); Clear solution
此方案可获得 ≥ 2.08 mg/mL (4.03 mM，饱和度未知) 的澄清溶液，此方案不适用于实验周期在半个月以上的实验。 以 1 mL 工作液为例，取 100 μL 20.8 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 900 μL玉米油中，混合均匀。 *以上所有助溶剂都可在本网站选购。
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